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1、適用范圍和作用不同

項目申請報告是政府行政許可的要求，它僅僅適用于企業(yè)投資建設實行政府核準制的項目，即列入“核準目錄”的企業(yè)投資項目。其作用是根據(jù)政府關注的公共管理要求，主要從維護經濟安全，合理開發(fā)利用資源、保護生態(tài)環(huán)境、優(yōu)化重大布局、保障公眾利益、防止出現(xiàn)壟斷等方面進行核準。政府投資項目和實行備案制的企業(yè)投資項目，均不需要編制項目申請報告。

2、目的不同

對于企業(yè)投資項目而言，可行性研究報告的目的是論證項目的可行性，提交企業(yè)內部決策機構(如企業(yè)董事會)審查批準；以及提交貸款方(包括內、外資銀行以及國際金融組織和外國政府)評估，以便其做出貸款決定。

頂目申請報告是對政府關注的項目外部影響，涉及公共利益的有關問題進行論證說明，以獲得政府投資主管部門的核準(行政許可)。在政府投資主管部門核準之前，根據(jù)有關規(guī)定，企業(yè)需要獲得規(guī)劃、自然資源等主管部門的許可。

3、內容不同

可行性研究報告不僅要對市場前景、技術方案、設備選型、項目選址、投資估算、融資方案、財務效益、投資風險等方面進行分析與研究；而且，要對政府關注的涉及公共利益的有關間題進行論證。

項目申請報告主要是從規(guī)劃布局、資源利用、征地移民、生態(tài)環(huán)境、經濟和社會影響等方面對擬建項目進行論證，對市場、技術、資金來源、財務效益等不涉及政府公權力等“純內部”問題， 不作為主要內容，但需要對項目有關間題加以簡要說明，作為對項目核準提供項目背景、外部影響評估的基礎材料。如：為了便于政府對發(fā)展規(guī)劃、產業(yè)政策及行業(yè)準人等內容進行審查，需要對采用工藝技術方案的先進性、創(chuàng)新性作簡要說明等。